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The publications listed below are papers and contributions to international congress either directly or indirectly related to the project. Thus, publications in the fields of biomedicine and biotechnology have been included. Also, publications concerning methodologies of potential use in systems biology have been listed.
2010
Congreso: International Conference in Systems Biology (ICSB)
Lugar de celebración: Edinburgh (UK)
Fecha: 11-14 Octubre 2010
Autores: A.F. Villaverde, J.A. Egea, J.R. Banga.
Título: Parameter estimation in complex systems biology models: novel numerical and computational strategies.
Congreso: International Conference in Systems Biology (ICSB)
Lugar de celebración: Edinburgh (UK)
Fecha: 11-14 Octubre 2010
Autores: E Balsa-Canto, JR Banga
Título: AMIGO: A model identification toolbox based on global optimization
Congreso: International Conference in Systems Biology (ICSB)
Lugar de celebración: Edinburgh (UK)
Fecha: 11-14 Octubre 2010
Autores: De Hijas-Liste, G. M.; Balsa-Canto E.; Banga J. R.
Título: Prediction of activation of metabolic pathways via dynamic optimization
Congreso: DYCOPS (9th International Symposium on Dynamics and Control of Process Systems)
Lugar de celebración: Lovaina, Belgica
Fecha: 5-7 Julio 2010
Autores: T Hirmajer, E Balsa-Canto, JR Banga
Título: Mixed-integer non-linear optimal control problems in systems biology: numerical methods and software toolbox
Congreso: Computer Applications in Biotechnology (CAB 2010)
Lugar de celebración: Lovaina, Bélgica
Fecha: 7-9 Julio 2010
Autores: E Balsa-Canto, JR Banga
Título: AMIGO: A model identification toolbox based on global optimization and its applications in bioprocess
Congreso: Systems Biology of Microorganisms
Lugar de celebración: Paris (Francia)
Fecha: 22-24 Marzo 2010
Autores: A.F. Villaverde, J.A. Egea, W. Liebermeister, E. Klipp, J.R. Banga
Título: Calibration of large-scale dynamic models in systems biology: a Pareto approach
Congreso: Systems Biology of Microorganisms
Lugar de celebración: Paris (Francia)
Fecha: 22-24 Marzo 2010
Autores: M. Uhr, A.F. Villaverde, J.A. Egea, J.R. Banga, J. Stelling.
Título: Inference of transcriptional control design of metabolic networks
Autores: Tortajada M, Llaneras F, Picó J.
Título: Possibilistic validation of a constraint-based model for P. pastoris under data scarcity
Tipo de participación: Charla
Congreso: IFAC International Conference Computer Applications in Biotechnology.
Publicación: –
Lugar celebración: Leuven, Bélgica Fecha: 2010
Autores: Llaneras F, Sala A, Picó J.
Título: Possibilistic estimation of metabolic fluxes during a batch process accounting for extracellular dynamics
Tipo de participación: Charla
Congreso: IFAC International Conference Computer Applications in Biotechnology.
Publicación: –
Lugar celebración: Leuven, Bélgica Fecha: 2010
Autores: Llaneras F, Sala A, Picó J.
Título: Dynamic flux balance analysis: a possibilistic approach
Tipo de participación: Poster
Congreso: Systems Biology of Microorganisms.
Publicación: –
Lugar celebración: Paris, Francia Fecha: 2010
J.M. Prats-Montalbán; J.I. Jérez-Rozo; R.J. Romanach; A. Ferrer, Evaluation of a Novel Pharmaceutical Formulation by NIR-Chemical Imaging and Multivariate Image Analysis, 24th International Forum Process Analytical Technology. Process Analysis & Control – IFPAC 10. Resumen publicado por IFPAC (2010), pág. 66 (Comunicación oral), Baltimore (EEUU).
S. Tarazona; S. Prado; A. Ferrer; A. Conesa, Variable Selection For Multifactorial Genomics Data, VII Colloquium Chemiometricum Mediterraneum. Resumen publicado por CCM VII (2010), PO 2-04 (Póster), Granada (España).
J.M.Prats-Montalbán, J.I. Jérez-Rozo, R.J. Romañach, A. Ferrer, NIR hyperimaging techniques for the evaluation of gel strips in pharmaceutical industry, VII Colloquium Chemiometricum Mediterraneum. Resumen publicado por CCM VII (2010), OP 1-09 (Comunicación oral), Granada (España).
A. Ferrer, J. M. Prats-Montalbán, Multivariate Image Analysis: from Grey-Level to Hyperspectral (NIR) Images, International Symposium on Business and Industrial Statistics-2010 (ISBIS 2010). Resumen publicado por ISBIS 2010, pág.33 (Ponencia invitada), Portoroz (Eslovenia).
A. Ferrer, Chemometrics in Process Control and Monitoring, XXII Convegno della Disione di Chimica Analitica della Società Chimica Italiana (2010) (Ponencia Invitada), Como (Italia).
J. Camacho, J. Picó, A. Ferrer, Cross-validation in principal component analysis: searching for the "best" approach, 12th International Conference in Chemometrics in Analytical Chemistry (CAC 2010). Resumen publicado por CAC 2010, pág. 3 (Ponencia invitada), Amberes (Bélgica).
J.M. González-Martínez, A. Ferrer, F. Arteaga, D. Aguado, J. Ribes, Error-proof Latent-based Multivariate Statistical Process Control of a Continuous Biological Nutrient Removal Process, 12th International Conference in Chemometrics in Analytical Chemistry (CAC 2010). Resumen publicado por CAC 2010, págs. 149-150 (Ponencia invitada), Amberes (Bélgica).
F. Arteaga, A. Ferrer, Building covariance matrices with the desired strucuture, 12th International Conference in Chemometrics in Analytical Chemistry (CAC 2010). Resumen publicado por CAC 2010, pág. 63 (Póster), Amberes (Bélgica).
J.M. Prats-Montalbán, JI Jérez-Rozo, RJ Romañach, A. Ferrer, Evaluation of polymeric gel strips by NIR, Chemicals Imaging and multivariate analysis, 12th International Conference in Chemometrics in Analytical Chemistry (CAC 2010). Resumen publicado por CAC 2010, pág. 258 (Póster), Amberes (Bélgica).
J.M. González-Martínez, A. Ferrer , F. Llaneras , M. Tortajada and J. Picó, Metabolic Flux Understanding of Pichia pastoris Grown on Heterogenous Culture Media, 12th International Conference in Chemometrics in Analytical Chemistry (CAC 2010). Resumen publicado por CAC 2010, pág. 86 (Póster), Amberes (Bélgica).
J.M. González-Martínez, A. Ferrer, J. Westerhuis, Real-time Synchronization of Batch Trajectories for On-line Multivariate Statistical Process Control using Dynamic Time Warping, 12th International Conference in Chemometrics in Analytical Chemistry (CAC 2010). Resumen publicado por CAC 2010, págs. 229-230 (Póster), Amberes (Bélgica).
Ferrer, A., Camacho-Páez J., González-Martínez, JM, Issues on Batch Multivariate Statistical Process Control, 2010 Eastern Analytical Symposium. Resumen publicado por EAS 2010, pág. 56 (Ponencia invitada), Somerset (New Jersey, EEUU).
2009
BALSA-CANTO E., BANGA J.R. Parametric identification using global optimization methods. Conferencia invitada. Workshop on "DATA ANALYSIS AND PARAMETER IDENTICATION". Lorentz Center, Leiden, Holanda, 2-5 Junio 2009.
BALSA-CANTO E., BANGA J.R. Computacional procedures for optimal model identification in systems biology. SYSID’09, IFAC INTERNATIONAL CONFERENCE ON SYSTEM IDENTIFICATION. Sant Malo, Francia, 6-8 Julio 2009
BALSA-CANTO E., BANGA J.R. Dynamic model building using an iterative parametric identification procedure. ICSB 2009 THE 10TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON SYSTEMS BIOLOGY. Stanford (USA), 30 Agosto- 4 Septiembre 2009
OTERO-MURAS I., BANGA J.R., ALONSO A.A., Parameter conditions for multistability in biochemical reaction networks: interval based search. ICSB 2009 THE 10TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON SYSTEMS BIOLOGY. Stanford (USA), 30 Agosto- 4 Septiembre 2009.
EGEA, J. A., BALSA-CANTO, E., BANGA, J. R. Dynamic optimization of chemical and bio-chemical processes using an efficient global optimization metaheuristic. MATHMOD 2009 – 6TH VIENNA INTERNATIONAL CONFERENCE ON MATHEMATICAL MODELLING. Viena (Austria), 10-13 febrero 2009
OTERO-MURAS I, BANGA JR, ALONSO AA, Parameter conditions for multistability in bio-chemical reaction networks. IET BIOSYSBIO CONFERENCE 2009 Cambridge (Reino Unido), 22-25 marzo 2009
Autores: Llaneras F, Sala A, Picó J.
Título: Applications of possibilistic reasoning to intelligent system monitoring: a case study
Tipo de participación: Charla
Congreso: IEEE Multi-conference on Systems and Control
Publicación: –
Lugar celebración: San Petersburgo, Rusia Fecha: 2009
Camacho; J. Picó; A. Ferrer, Run-to-run Optimization of Fed-batch Processes with Unfold-PLS, 23nd International Forum Process Analytical Technology, Process Analysis & Control – IFPAC 09.Resumen publicado por IFPAC (2009), pág. 74 (Comunicación oral). Baltimore (EE.UU.)
J. Camacho; J. Picó; A. Ferrer, Phase Analysis Framework: Pattern Recognition for Batch Process Modelling, 23nd International Forum Process Analytical Technology. Process Analysis & Control – IFPAC 09. Resumen publicado por IFPAC (2009), pág. 75-76, (Comunicación oral). Baltimore (EE.UU.)
J.M. Prats-Montalbán; A. Ferrer, MIA Code: a global software for Multivariate Image Analysis and Process Monitoring, 23nd International Forum Process Analytical Technology. Process Analysis & Control – IFPAC 09. Resumen publicado por IFPAC (2009), pág. 76, (Comunicación oral). Baltimore (EE.UU.)
Camacho, J; Picó, J.; Ferrer, A., Data Understanding with principal component analysis, 11th Scandinavian Symposium on Chemometrics. Resumen publicado por SSC11 (2009) , pág. 44 (Comunicación oral). Loen (Noruega).
Camacho, J; Picó, J.; Ferrer, A., Covariance Maps for Batch Process Modelling, 11th Scandinavian Symposium on Chemometrics. Resumen publicado por SSC11 (2009), pág. 73 (Póster). Loen (Noruega).
Prats-Montalbán, J.M.; Ferrer, A., Applications and benefits of PLS-DA based MIA for isolation and quantification of different kind of features. Comparison with other traditional segmentation techniques, 11th Scandinavian Symposium on Chemometrics. Resumen publicado por SSC11 (2009), pág. 102 (Póster). Loen (Noruega).
González-Martínez, J.M.; Ferrer, A., A Comparison of Different Methods for Synchronization of Batch Trajectories, 11th Scandinavian Symposium on Chemometrics. Resumen publicado por SSC11 (2009), pág. 83, (Póster). Loen (Noruega).
A. Ferrer; Prats-Montalbán, J.M., 3-way methods: a practitioner perspective, ThRee-way methods In Chemistry And Psychology (TRICAP, 2009). Resumen publicado por Universitat de Barcelona, pág. 26 (Comunicación oral). Vall de Núria (Spain)
Autores: Llaneras F., Sala A., Picó J.
Título: A possibilistic framework for metabolic flux analysis
Tipo de participación: Charla
Congreso: Reunión de la Red Española de Biología de Sistemas (REBS08)
Publicación: –
Lugar celebración: Valencia Fecha: 2008
Autores: Tortajada M., Llaneras F., Picó J.
Título: Constraint-based modelling applied to heterologous protein production with P. pastoris
Tipo de participación: Poster
Congreso: Reunión de la Red Española de Biología de Sistemas (REBS08)
Publicación: –
Lugar celebración: Valencia Fecha: 2008
Autores: Llaneras F, Tortajada M, Picó J
Título: Structural analysis of metabolic pathways applied to heterologous protein production in P. Pastoris.
Tipo de participación: Poster
Congreso: 13th European Congress on Biotechnology
Publicación: (Abstract) Journal of Biotechnology. 131(2)S209
Lugar celebración: Barcelona Fecha: 2007
Autores: Llaneras F, Bastin G., Picó J
Título: On metabolic flux analysis when measurements are insufficient and/or uncertain: the flux spectrum and the flux space
Tipo de participación: Poster
Congreso: IAP Dysco workshop
Publicación: –
Lugar celebración: Bélgica Fecha: 2007
Autores: F. Llaneras, J. Picó.
Título: The linkage between flux distributions and elementary modes activity patterns: An interval Approach
Tipo de participación: Poster
Congreso: 1st International Symposium on Systems Biology
Publicación: (Ver arriba)
Lugar celebración: Murcia Fecha: 2006
Autores: F. Llaneras, J. Picó, J. L. Navarro, E. Picó-Marco.
Título: Diseño E Implementación de un Entorno Gráfico de Simulación, Monitorización y Control de Biorreactores
Tipo de participación: Artículo y Poster
Congreso: XXVI Jornadas De Automática
Publicación: Eds: F. Torres, Q. Reinoso, ISBN: 84-689-0703-8, 2005
Lugar celebración: Alicante Fecha: 2005
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